Graphpad Prism是一款PC电脑端使用的 专业统计绘图软件。该软件集多种实用功能于一体,包括:生物统计、科研绘图、曲线拟合 于一体。软件专门为科研工作者设计,可以轻松地进行统计分析并绘制统计图。
GraphPad Prism 的设计逻辑方式比较特别,在用户输入数据之前,软件会预先给出工作思路,用户设置实验设计怎样的,由此决定你该用什么格式的数据表,做什么样的分析,这样的反式工作逻辑强调的是先做事,再去思考完善。
GraphPad Prism 功能简介:
一、统计比较
- Fisher 精确检验或卡方检验。 计算含置信区间的相对风险和优势比。
- 在不假设群体具有相同标准偏差的情况下,使用 Brown-Forsythe 和 Welch 方差分析进行单因素方差分析,然后进行适当的比较检验(Games-Howell、Tamhane T2、Dunnett T3)
- 含 Dunn 后验的 Kruskal-Wallis 或 Friedman 非参数单向方差分析。
- 对一个或两个因素进行重复测量的数据进行双向方差分析。 Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni、Holm-Sidak 或 Fisher LSD 多重比较检验主要和简单效应。
- 进行 Greenhouse-Geisser 校正,因此重复测量的单向、双向和三向方差分析不必假设结果呈球形分布。 选择此项时,多个比较检验也不必假设呈球形分布。
- 自动生成多次 t 检验分析的火山图(差值相比于 P 值)。
- 一次执行多个 t 检验,使用错误发现率(或 Bonferroni 多重比较)选择哪些比较是需要进一步研究的发现。
- 对即使在某些后验中仍缺少数值的数据进行双向方差分析。
- 使用混合效应模型(类似于重复测量方差分析,但能够处理丢失的数据),分析重复测量数据(单向、双向和三向)。
- 三向方差分析(限制在其中两个因素中的两个级别,和在第三个因素中的任意数量的级别)。
- 非参数 Mann-Whitney 检验,包括中位数差值的置信区间。
- 使用嵌套 t 检验或嵌套单向方差分析比较嵌套数据表中的数据(使用混合效应模型)。
- 许多多重比较测试都伴随着置信区间和多重性调整的P值。
- 含中位数置信区间的 Wilcoxon 检验。
- 用于比较两组的 Kolmogorov-Smirnov 检验。
- 配对或非配对 t 检验。 报告 P 值和置信区间。
- Kaplan-Meier 生存分析。 应用对数秩检验(包括趋势检验)比较曲线。
- 进行普通或重复测量方差分析,然后进行 Tukey、Newman-Keuls、Dunnett、Bonferroni 或 Holm-Sidak 多重比较检验,趋势后验或 Fisher 最小显著性检验。
二、列统计
对数正态性检验,以及从正态(高斯)与对数正态分布中取样的可能性。
分析批量 P 值,应用 Bonferroni 多重比较或 FDR 方法识别“重大”研究结果或发现。
含置信区间的均值或几何均值。
频率分布(从 bin 到直方图),包括累积直方图。
使用 Grubbs 或 ROUT 方法鉴别异常值。
单样本 t 检验或 Wilcoxon 检验,用于对柱均值(或中位数)和理论值进行比较。
创建 QQ 图作为正态性检验的一部分。
计算描述性统计: 最小值、最大值、四分位数、均值、标准差(SD)、标准误(SEM)、置信区间(CI)、变异系数(CV)、偏度、峰度。
通过四种方法进行正态性检验(新功能: Anderson-Darling)。
三、非线性回归
- 在指定的X值范围内自动绘制曲线图。
- 运行或复制模型充分性检验。
- 应用约束。
- 输入微分或隐式方程。
- 通过几种方法差分权重,并评估加权方法的效果。
- 报告协方差矩阵或依赖集。
- 全局非线性回归 – 在数据集之间共享参数。
- 使用额外的平方和 F 检验或 AICc 比较模型。
- 检验残差的正态性。
- 将直线拟合到两个数据集,并确定交点和双方斜率。
- 绘制置信度或预测带。
- 自动识别或消除离群值。
- 强大的非线性回归功能。
- 应用 Hougaard 偏度量化不精确的对称性。
- 比较数据集之间的参数。
- 输入用于不同数据集的方程。
- 接受自动初始估计值或输入您自己的值。
- 从最佳拟合曲线中轻松插入数据点。
- 使用参数 SE 或 CI 量化拟合精度。 置信区间可为对称性(传统上)或不对称性(更准确)。
- 拟合我们的 105 个内置方程式之一,或输入您自己的方程式。 现在包括生长方程族: 指数生长、指数平台、Gompertz、Logistic 和 beta(先增长后衰减)。
四、其他计算
- 标准化。
- 转置表格。
- 转换数据。
- 鉴别异常值。
- 正态性检验。
- 曲线下面积,含置信区间。
- 减去基线(以及合并列)。
- 将每个值计算为其行、列或总计的分数。
GraphPad Prism 新功能:
- 生成碎石图(Scree Plots)、分数图(Score Plots)和双标图(Biplots)。
- 自动识别变量类型 - 将多变量数据表中的变量识别为连续值,分类值或标签值。
- 自动变量编码 - 输入您的数据,让Prism负责其余的工作。
- 自动准备PCA的结果,以进一步用于多元线性回归(PCR - 主成分回归)。
- 提高了数据列的上限 - 在每个数据表中最多输入1024列数据。
- 通过平行分析(以及Kaiser方法,总方差阈值方法等)来选择成分。
- 数据表可输入文本信息 - 直接以文本形式输入数据。无需将变量编码“0”和“1”,只需直接在数据表中输入例如“Male”和“Female”。
GraphPad Prism 激活版 下载地址:
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